جاناتان ویلیام لیپنیکی در ۲۲ اکتبر ۱۹۹۰ در وست لیک، کالیفرنیا ایالات متحده متولد شد. او از کودکی با استعدادی آشکار وارد صنعت سینما شد و عمده شهرت خود را در همان سال‌های نخست زندگی کسب کرد. لیپنیکی در یک خانواده با پیشینه هنری متولد نشد، اما مادرش که یک تهیه‌کننده تلویزیونی بود، نقش کلیدی در راهنمایی حرفه‌ای او داشت.
معروف‌ترین نقش آفرینی او در شش سالگی و با ایفای نقش ری توماس در فیلم کمدی-درام "جری مگوایر" (۱۹۹۶) در کنار تام کروز و رنه زلوگر رقم خورد. عملکرد شیرین و دیالوگ‌های به یاد ماندنی او در این فیلم، از جمله صحنه‌های معروف دربارهٔ "مغز انسان"، توجه جهانیان را به این کودک بازیگر جلب کرد.
پس از این موفقیت، او به عنوان بازیگر کودک به فعالیت خود ادامه داد و در دو فیلم خانوادگی محبوب به نام‌های "داستان یک شوالیه" (۲۰۰۱) و دنباله آن "داستان یک شوالیه ۲: مربع قهرمان" (۲۰۰۶) در نقش جیکوب وایت ظاهر شد. همچنین در فیلم‌های "مهمانی بزرگ کوچک استوارت" (۱۹۹۹) و "مثل مایک" (۲۰۰۲) نیز ایفای نقش کرد.
با ورود به دوران نوجوانی و جوانی، لیپنیکی مانند بسیاری از بازیگران کودک، دوره‌ای از کاهش حضور در نقش‌های اصلی را تجربه کرد، اما هرگز کاملاً از صنعت فیلم خارج نشد. او در سال‌های بعد در فیلم‌های مستقل، مجموعه‌های تلویزیونی و همچنین فیلم‌های ترسناک مانند "برای امشب تنها باش" (۲۰۱۴) و "بالن" (۲۰۱۹) ظاهر شد.
لیپنیکی در مصاحبه‌های مختلف دربارهٔ فشارهای دوران بازیگری کودک و زورگری‌هایی که در مدرسه به دلیل شهرت تحمل کرده، صحبت کرده است. او فارغ‌التحصیل رشته سینما از دانشگاه کالیفرنیای جنوبی است و علاوه بر بازیگری، در زمینه‌های نویسندگی و تهیه‌کنندگی نیز فعالیت داشته است. جاناتان لیپنیکی اکنون در دهه چهارم زندگی خود به سر می‌برد و به عنوان یکی از چهره‌های به یاد ماندنی سینمای کودک دهه ۹۰ و ۲۰۰۰ میلادی شناخته می‌شود.
